Asam amino adalah unit penyusun dasar protein dalam semua organisme hidup. Secara struktural, setiap asam amino memiliki gugus amino ($\text{NH}_2$), gugus karboksil ($\text{COOH}$), atom hidrogen, dan rantai samping (gugus R) yang terikat pada karbon alfa ($\text{C}\alpha$). Perbedaan sifat antara 20 asam amino standar terletak pada gugus R ini.
Salah satu kategori paling penting berdasarkan sifat gugus R adalah asam amino non polar. Asam amino ini dicirikan oleh rantai samping yang didominasi oleh atom karbon dan hidrogen, yang menghasilkan sifat hidrofobik atau "takut air". Karena sifatnya yang non polar, gugus R ini cenderung menghindari lingkungan berair, menjadikannya komponen krusial dalam menentukan struktur tiga dimensi (3D) protein.
Sifat hidrofobik adalah ciri khas utama. Dalam lingkungan seluler yang sebagian besar terdiri dari air (lingkungan polar), asam amino non polar akan berusaha menjauhi air. Interaksi ini sangat penting dalam proses pelipatan protein (protein folding).
Ada sembilan asam amino standar yang diklasifikasikan sebagai non polar. Beberapa di antaranya memiliki rantai samping yang relatif sederhana, sementara yang lain memiliki struktur cincin alifatik:
Peran asam amino non polar tidak hanya terbatas pada penyimpanan energi, tetapi lebih mendalam pada arsitektur protein. Ketika rantai polipeptida baru disintesis, ia akan secara spontan berusaha melipat ke dalam bentuk tiga dimensi yang paling stabil secara termodinamika. Proses ini dikenal sebagai pelipatan protein.
Dalam lingkungan berair, asam amino non polar didorong untuk bermigrasi ke dalam inti protein, menjauhi molekul air. Fenomena ini, didorong oleh efek hidrofobik, adalah kekuatan utama yang menyatukan struktur protein globular yang fungsional. Jika asam amino non polar berada di permukaan luar protein yang seharusnya larut, protein tersebut kemungkinan besar akan salah lipat (misfolded) dan menjadi tidak aktif atau bahkan menyebabkan agregasi protein yang berbahaya.
Demikian pula, asam amino non polar sangat penting dalam pembentukan domain membran protein. Mereka berinteraksi kuat dengan lipid bilayer, menambatkan protein sehingga dapat berfungsi sebagai saluran, reseptor, atau pompa melintasi membran sel.
Karena peran vital mereka dalam stabilitas dan fungsi protein, mutasi genetik yang mengubah asam amino non polar menjadi polar (atau sebaliknya) dapat memiliki konsekuensi serius. Contoh klasik adalah penyakit anemia sel sabit (sickle cell anemia), di mana penggantian satu asam glutamat (polar/asam) dengan satu valin (non polar) pada rantai beta hemoglobin mengubah kelarutan dan bentuk sel darah merah secara drastis.
Memahami distribusi dan interaksi asam amino non polar memberikan wawasan mendalam mengenai bagaimana struktur molekuler menentukan fungsi biologis dalam sel hidup.